步骤1：将灌肠袋清洗干净后，关上止水阀咖啡灌肠使用的灌肠袋，其实就是在点滴袋上加装灌肠软管，在一般医疗器材店都可以买得到。每次使用过后清洗消毒干净，可以重复使用。
步骤2：将咖啡灌肠液加入约37℃的温水除了加入接近人类体温的温水，建议还可以加入约0.5克的天然海盐或海洋深层水来平衡电解质，使灌肠液的电解质更接近人体，提高渗透力。
建议刚开始进行咖啡灌肠的人，第一次只要加入600毫升的水即可，让身体先行适应，之后逐次再增加到1000毫升。
步骤3：将灌肠袋挂在高处将装入灌肠液的灌肠袋挂高，约人的身高即可。我自己则习惯用衣架吊起来。
步骤4：挤出灌肠管中的空气打开灌肠管上的止水阀，让液体流出同时将灌肠管内空气挤出，之后再关上止水阀。
步骤5：将灌肠管前端涂上乳液建议可涂上天然乳液、液状的维生素E、芦荟或是亚麻仁油等。
步骤6：身体采右侧躺
通常我在进行咖啡灌肠时，会铺个浴巾躺在床边的地板上，地点最好不要离厕所太远。
步骤7：将灌肠管插入并打开止水阀采右侧躺姿势，并将左脚自然弓起，将灌肠管轻轻放进肛门约15厘米深，打开止水阀约三分之一，约15~20分钟可滴完。速度视各人情况调整，如果忍不住便意可放慢速度，或是先关掉止水阀，忍住三十秒到一分钟，等便意减低再继续。如果确实忍不住，先去上厕所也没关系，可以分两次进行也不会影响效果。建议进行灌肠时可以听听音乐，放松心情。
步骤8：滴完后躺正，按摩左侧腹部约三到五分钟待灌肠液滴完后，身体躺正，可将双脚晓起来靠在床上或墙上，身体形成L型。然后从左腹部开始按摩，绕着肚脐以顺时针方向进行，按摩三至五分钟就可以上厕所了。这个时候其实已经有便意，如果忍不住，省略按摩步骤直接上厕所也可以。但我建议忍一下，做完按摩会排得更干净。
在按摩时会听到肚子里有水声，这时灌肠液就像漱口水清洁口腔一样在清洗肠壁。在上厕所时也可做顺时针腹部按摩，帮助将宿便排干净。
步骤9：灌肠结束后，补充蔬果汁或矿物质及益生菌在进行灌肠之前和之后都可以喝一杯蔬果汁，以补充流失的水分，同时也平衡一下体内的电解质，降低灌肠时因外来液体侵入可能发生的不适感。灌肠之后也可以吃一点乳酸菌，补充一下肠道内的好菌，加强排毒的效果。
步骤10：清洗器材
灌肠结束之后，灌肠袋里会留下一些咖啡渣，可以加入过滤水让它流掉。接触过肛门的那段灌肠管必须用肥皂清洗干净。袋内清洗干净之后，加入天然抑菌剂或酒精让它再一次流掉，作为消毒。另外在管子的末端也必须进行消毒。
清洁后将灌肠袋和灌肠管保持干燥，就可以重复使用。连续使用一个月之后再更换新的灌肠软管。要特别注意的是，即使是家人，也不要共享同一支灌肠管。
制作咖啡涨肠液
◎材料：
有机咖啡豆10克（约咖啡专用匙1.5匙），现磨成粉备用。
微碱性的好水1000毫升。
◎做法：
300毫升水煮开后，将有机咖啡粉放入煮滚约3分钟，用小火煮10分钟后，用咖啡滤纸过滤，再加入温水500毫升至1000毫升，待咖啡温度降至如同体温即可使用。
◎说明：
进行咖啡灌肠时，咖啡液会由肠黏膜直接吸收到肝脏，效果非常快，因此自制的咖啡液一定要使用有机咖啡豆，不能使用一般的咖啡豆，才不会有农药残留的问题。如果觉得DIY咖啡灌肠液太麻烦，现在市面上有机商店也有卖日本进口的有机咖啡灌肠液，里面还添加了乳酸菌生成物及天然海盐，不用自己煮，十分方便。
