益生菌是一种以活菌为主的微生态制剂，它可以在动物肠道中定植，维护肠道菌群的平衡，同时刺激机体免疫发育，合成对机体有益的营养物质，进而维持机体健康，抗生素滥用导致了耐药性和药物残留的问题，益生菌开始作为抗生素的替代品应用在畜禽当中。研究表明，益生菌和低浓度抗生素的促生长效果是一样的。生产中，益生菌抗病、促生长，而且无毒副作用、无残留。
肠道之中的有害菌包括：沙门菌、葡萄球菌、绿脓杆菌、产生荚膜的杆菌等。益生菌包括：双歧杆菌、乳酸菌等。
日本京都大学代田焾博士就提出了“健肠长寿”之说，一旦肠道内的微环境发生变化，导致菌群失调，有害菌数量增加，肠道就会衰老。人体的衰老和肠道的衰老有着直接的关系。大肠里面的有害菌分解代谢食物残渣产生的有害毒素会让机体中毒，诱发衰老。
想要为健康长寿打基础，首先要确保肠道的干净、健康，益生菌是肠道的清道夫，负责着肠道健康。
益生菌是活的微生物，摄入充足时，它会对宿主产生一种或多种经过论证的功能性健康益处，被认可的益生菌一定是经人类长期安全食用并且已经被证明功效的。将益生菌储存在冷藏或冷冻的环境中能保持较高的活性，主要特征为：对酸和胆汁稳定，对人体肠胃细胞黏着，在人体肠胃里可以持久存在，能产生细菌素，临床上已经确认了它的健康作用，临床运用和日常食用有安全性，能对抗病菌。
在我们的肠道之中有超过10的十三次方个细菌，总重量是0．9～1．4千克，而且种类超过400种，这些肠内细菌之中，有益生菌也有有害菌，它们在肠道之中的比例动态变化，灵敏地反映出人体状况。
人体内的肠道菌群会随着年龄的变化而发生变化：婴儿期，肠道之中益生菌所占比例比较大；成年期开始摄入杂食类食物，偏食、新陈代谢不佳、体内酸碱不平衡、严重感染、服用抗生素等都会导致自身免疫力降低、肠胃功能失调，导致腐败菌占优势，益生菌数目大大减少；到了老年期，身体整体功能自然老化，肠道活力下降，腐败菌上升，这就是肠道老化现象。
益生菌通过食物或膳食补充物被摄入体内，经口腔、食道、胃进入整个肠道。有害菌威胁着人体健康，当肠道之中的细菌失衡时，有害菌的数量增多，就会产生出有害物质。肠道之中的有害菌包括：
沙门菌、葡萄球菌、绿脓杆菌、产生荚膜的杆菌等。益生菌包括：
双歧杆菌、乳酸菌等。应该懂得利用益生菌保持肠道健康。
有害菌对机体健康的影响：产生大量氨，影响肝功能，产生大量胺，诱发消化性溃疡、高血压和癌症；产生吲哚、酚类等致癌物；荚膜梭菌会产生致癌性二次胆汁酸。
益生菌对机体健康的影响：益生菌可以产生乳酸、醋酸等酸性物质，抑制肠道中腐败菌的生长；通过营养物的竞争让有害菌的生存、繁殖变得困难；通过占据肠道壁的良好黏附，竞争性排除有害菌；平衡肠道pH；确保和天然免疫系统相关的肠道内优化菌群的平衡。
益生菌可以抑制肠道有害菌的生长和毒素的产生，乳酸杆菌、双歧杆菌通过在肠内发酵糖类产生乳酸和醋酸，抑制有害菌生长，减少毒素产生。乳酸菌和双歧杆菌生成的酸促进肠道的消化和吸收功能，这些有机酸还可以促进肠道的消化、吸收功能，刺激肠道蠕动，促进排便，它们对致病菌的抑制作用还可防治感染导致的细菌性腹泻。乳酸菌和双歧杆菌产生的有机酸和细菌素能减少食物导致的细菌感染的可能性。
益生菌能通过激活免疫蛋白来提升机体免疫力，进而预防疾病的发生，还能通过平衡免疫系统来避免免疫过激导致的湿疹、过敏性鼻炎、哮喘等过敏性疾病。益生菌能生成维生素，促进营养物质的吸收。益生菌可以吸附某些致癌物，降低某些“癌酶”的活性。
