月经结束后还有咖啡色分泌物异常分泌物可能是月经没有干净、排卵期、子宫内膜炎等多种原因所造成的，需要根据个人的原因做针对性的调整。
1、月经没有干净：在月经后期子宫内膜脱落比较少，有可能会导致出现月经量明显的减少，而且还会在阴道和宫腔内长时间储存，从而导致出现颜色改变，这是属于正常的现象，不需要做特殊的调整。
2、排卵期：月经过后会进入到排卵期，体内的激素水平会发生改变，还会导致出现少量的子宫内膜脱落，也会出现褐色分泌，这是属于正常的现象。
3、子宫内膜炎：月经结束后还有咖啡色分泌物异常分泌物可能是子宫内膜炎所引起的，在受到炎症刺激之后有可能会导致分泌物异常。一般需要在医生指导下使用甲硝唑片、罗红霉素分散片、阿奇霉素分散片等药物调整。
除了以上比较常见的原因之外，还有可能是宫颈炎所导致的，需要到医院通过进一步的检查确诊。
