怀孕三个月左侧肚子有点隐隐作痛是生理性原因、胃肠道疾病、附件区牵拉疼痛等，在怀孕后出现肚子疼痛，需要到医院检查，疾病因素引起还需要尽早干预治疗。
1、生理性原因：在怀孕后随着胚胎生长，子宫会不断增大，拉扯到腹部韧带，会引发腹部疼痛，属于正常生理反应。
2、胃肠道疾病：在怀孕后使用变质食物或者食用了生冷食物，就有可能会对肠道造成刺激，引发肠痉挛，也会引发肚子疼痛，可以对局部做热敷或者按摩能起到改善作用。
3、附件区牵拉疼痛：在怀孕后随着子宫增大会拉扯到子宫周围，输卵管和卵巢被动生长会引发牵拉疼痛，不可以做剧烈活动，还需要控制好个人情绪。
先兆流产、急性胃炎也有可能会引发腹部疼痛，需要根据病因来做调整。
