孕囊细长的原因一般是胚胎质量异常、孕囊位置低、宫腔的因素等，这些都是比较常见到的因素。
1、胚胎质量异常：孕囊细长的原因比较多，有一部分和孕囊的本身问题有关系，如果出现了生长发育异常，很可能会造成质量的问题，要及时到医院做诊断，必要的时候终止妊娠。
2、孕囊位置低：孕囊细长要让专业医生做B超检查，有一部分是因为孕囊的位置比较低，所以看起来是细长的，要及时做保胎治疗。
3、宫腔因素：孕囊细长也不排除和宫腔因素有关系，如果女性的宫腔本来就比较细长，也可能会导致孕囊细长，没有其他不良表现者，可以随着时间推移先继续观察。
除了以上这些原因之外，也不排除是先兆流产的症状。
