怀孕3周有褐色分泌物可能是孕囊着床、先兆流产、子宫内膜炎等因素导致的，需要明确原因对症治疗。
1、孕囊着床：在怀孕早期孕囊着床到子宫内膜的时候，会引起少量的阴道出血，从而会出现怀孕3周有褐色分泌物。属于正常的情况，不需要处理。
2、先兆流产：怀孕早期如果孕妇做剧烈的运动，容易引起先兆流产，因此会出现有褐色分泌物，同时还会伴有腹痛症状。可以在医生指导下服用黄体酮胶囊、地屈孕酮片、维生素E软胶囊等药物。
3、子宫内膜炎：在怀孕早期，孕妇抵抗力会下降，如果不注意个人卫生会引起子宫炎症，会引起阴道异常出血，从而会出现怀孕3周有褐色分泌物。可以在医生指导下服用头孢克肟胶囊、阿莫西林克胶囊、头孢克洛胶囊等药物治疗。
除了以上原因，也可能是宫外孕造成的，具体原因需要到医院就诊检查，然后进行针对性治疗。
