药物流产第六天肚子疼可能是胃肠受凉、药物流产不全、妇科炎症等原因引起，需要根据不同的病因对症治疗。
1、胃肠受凉：药物流产后身体比较虚弱，消化能力也会下降，不良的饮食方式容易导致胃肠受凉，可能会造成肚子疼和腹泻，可以通过局部热敷，在医生指导下口服肠道益生菌、蒙脱石散等药物。
2、药物流产不全：药物流产过程当中可能会导致宫腔内有残留物，也会引起子宫收缩痉挛，可以在医生指导下口服益母草颗粒、新生化颗粒等药物。
3、妇科炎症：存在妇科炎症药物流产后容易受到感染，可能会引起肚子痛，如盆腔炎、子宫内膜炎等，可遵医嘱口服甲硝唑片、阿莫西林胶囊等药物。
除上述原因外，也有可能是流产不全的原因，需要及时入院检查。
